| Dato | Ind | Ud | Fra/til |
|---|---|---|---|
| 01.07.06 | Jesper Grønkjær | VfB Stuttgart | |
| 01.07.06 | Fredrik Berglund | Esbjerg | |
| 01.07.06 | Oscar Wendt | IFK Göteborg | |
| 01.07.06 | Thomas Villadsen | U19 | |
| 01.07.06 | Nikolaj Hansen | U19 | |
| 01.07.06 | Jamil Fearrington | U19 | |
| 01.07.06 | Mads Torry Lindeneg | Vejle | |
| 01.07.06 | Peter Ijeh | Viking Stavanger | |
| 01.07.06 | Urmas Rooba | Vejle | |
| 01.07.06 | Thomas Røll | FC Midtjylland | |
| 01.08.06 | Álvaro Santos | Sochaux | |
| 01.09.06 | Morten Bertolt | HamKam (udleje) | |
| 01.09.06 | Hjalte Nørregaard | Heerenveen | |
| 02.12.06 | Lasse Qvist | U19 | |
| 01.01.07 | Ailton Almeida | Örgryte | |
| 01.01.07 | Morten Bertolt | HamKam (lejeophør) | |
| 01.01.07 | Martin Bernburg | FC Nordsjælland | |
| 10.01.07 | Martin Bergvold | Livorno | |
| 11.01.07 | Niclas Jensen | Fulham | |
| 31.01.07 | Nathan Coe | PSV | |
| 15.03.07 | André Bergdølmo | Strømsgodset | |
| 27.03.07 | Razak Pimpong | Viking Stavanger |