| Dato | Ind | Ud | Fra/til |
|---|---|---|---|
| 01.07.08 | Jacob Albrechtsen | U19 | |
| 01.07.08 | Danni Jensen | U19 | |
| 01.07.08 | Morten Bertolt | Viborg FF (lejeophør) | |
| 01.07.08 | Marcus Allbäck | Örgryte | |
| 01.07.08 | Michael Silberbauer | Utrecht | |
| 01.07.08 | Lasse Qvist | Lyngby | |
| 06.07.08 | Michael Gravgaard | Nantes | |
| 08.07.08 | Morten Bertolt | SønderjyskE | |
| 15.07.08 | Thomas Kristensen | FC Nordsjælland | |
| 24.07.08 | César Santin | Kalmar FF | |
| 25.07.08 | Peter Larsson | Halmstads BK | |
| 01.01.09 | Martin Vingaard | Esbjerg | |
| 01.01.09 | Johan Wiland | Elfsborg | |
| 01.01.09 | Nikolaj Hansen | Frem | |
| 12.01.09 | Dame N'Doye | OFI Kreta | |
| 14.01.09 | Mads Laudrup | Herfølge | |
| 02.02.09 | Rasmus Würtz | Vejle (udleje) | |
| 02.02.09 | José Junior | FC Nordsjælland (udleje) | |
| 02.02.09 | Nathan Coe | Örgryte (udleje) |